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蛋白质蛋白质相互作用PPI

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  • TA的每日心情

    2020.1.14 16:23
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    发表于 2018.6.24 18:48:45 | 显示全部楼层 |阅读模式

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    最近在做PPI,是绵羊的数据,但string数据库中没有这个物种,我可以怎么办吗?可以用牛的吗?我看他们亲缘关系挺近的,不知道有没有文章这么做。

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     楼主| 发表于 2018.6.25 09:01:45 | 显示全部楼层
    我解决这个问题了。
    1.虽然没有数据库,但公司说可以用blast预测序列;
    2.上面的方法我不会用,但是我找到了其他途径。因为我的数据是做了WGCNA分析的,出来了包涵“节点”的文件,这个文件可以直接导入cytoscape里面做网络,我再将模块的注释文件导入就可以按照模块分类来分析了。
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