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蛋白质搜库

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    发表于 2018.12.14 21:59:58 | 显示全部楼层 |阅读模式

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    细菌亚种的搜库,二代测序,自己拼装的序列有;做了3个时期的转录组(参考同源性99%基因组,加上自己的质粒序列);Uniprot的菌株--种--的蛋白数据库;三者之间,那个用来进行蛋白质组的搜库最好?
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    发表于 2018.12.21 09:41:41 | 显示全部楼层
    当然用基因组的库,但要注意注释是否完整。 正确的做法:使用转录组和蛋白组数据,对基因组序列进行注释。然后用基因组的库。
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     楼主| 发表于 2018.12.25 08:43:23 | 显示全部楼层
    基迪奥-周煌凯 发表于 2018.12.21 09:41
    当然用基因组的库,但要注意注释是否完整。 正确的做法:使用转录组和蛋白组数据,对基因组序列进行注释。 ...

    谢谢,具体该怎么操作,您可以说一下么
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    发表于 2018.12.26 19:54:47 | 显示全部楼层
    x-mas 发表于 2018.12.25 08:43
    谢谢,具体该怎么操作,您可以说一下么

    基因组注释比较复杂,好像不好一两句话说清楚。
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