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出门上学和在家听课,你喜欢哪个?

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    发表于 2020.3.24 11:48:05 | 显示全部楼层 |阅读模式
    眼看着春光日渐明朗,不少地方都已经公布了复工开学的时间,基迪奥也已经陪大家度过了一段愉快的学习时光。那么在学校正式开学前,三月份最后一周的直播课也安排上了~大家的学习热情,就由我们来承包!

    周  二

    《一节课掌握曼哈顿图的绘制与应用》
    曼哈顿图是全基因组测序分析(包括GWAS,群体遗传分析等)结果展示的最常用图形。本节直播课,将为大家讲解曼哈顿图的应用情景以及演示若干种用R包进行曼哈顿图绘制的方法(课程后会提供相关的R脚本)。


    由于是实操课程,建议大家提前安装好R软件和 CMplot包、qqman以及其他相关安装包(具体安装方法请见文末)。如果没有R语言基础,大家可花1-2小时,提前自学《R语言从入门到进阶之路》的第一节内容。

    课程链接:https://www.omicshare.com/class/home/index/series?id=1

    直播时间:3月24日(周二)16:00通知群:基迪奥Omicsmart基因组群


    周  三

    《环境因子研究意义及应用》

    微生物群落的物种多样性、菌群结构、物种组成与生境内的环境因子密切相关,探讨微生物与环境因子的关联,有利于揭示组间差异的驱动/响应机制,为临床诊断、环境监测等提供参考。如何判断物种与环境因子是否相关?有何关联?欢迎参加本周三的在线课堂寻找解决方法。

    环境因子关联分析模型示例

    直播时间:3月25日(周三)16:00通知群:基迪奥Omicsmart微生物群


    周  四

    《常见数据库介绍》

    转录组功能分析的部分主要包含三部分内容:传统富集分析、GSEA富集分析和基于数据库的功能注释。上两周转录组的课程已经给大家讲解过了前两部分富集分析的内容,那么这周转录组的课程就给大家介绍几个常用的功能注释数据库。通过不同的数据库,我们就可以从不同角度了解不同的基因功能。根据实验的不同,我们就可以在不同的数据库中了解基因背后的功能,最终获得和实验相关的目标基因。


    直播时间:3月26日(周四)16:00
    通知群:基迪奥Omicsmart转录组2群



    周  五

    《Origin科研作图快速上手》

    在科研文章中,图表是展示自己科研成果最主要的方式,专业、美观的科研图表会让你的文章、报告更加出彩!Origin目前是公认的专业科研图表绘制软件,对于初学者来说,具有一定的学习门槛。

    本期课程主要内容是介绍坐标轴“截断”柱状图、热图、分组散点图和玫瑰图的绘制方法,四种图表数据结构完全不一样,希望通过这四个具体案例的实操,让未接触过Origin的小伙伴能快速上手Origin。


    由于是实操课,建议大家提前安装好软件。
    Origin 2020软件安装方法:https://www.omicshare.com/forum/thread-5107-1-1.html

    直播时间:3月27日(周五)16:00

    通知群:基迪奥生信交流6群


    以上就是本周直播课内容预告,老师们可以根据自己的兴趣扫码加入对应组学讨论群等待通知,我们的讲师也在群内为大家答疑解惑。如果不小心错过直播,你也可以加入感兴趣的QQ群,录播视频上线Omicshare在线课堂后,工作人员会在群内通知大家。

    而在即将到来的四月份,我们仍给大家安排了诚意满满的新系列课程~课程通过解读经典文章,手把手带大家学习数据挖掘和文章思路,课程安排具体如下,老师们可以提前加入对应群组等待通知:


    如果你想观看更多其他课程,欢迎登陆我们Omicshare在线课堂搜索感兴趣的内容。

    视频观看方式

    电脑端:登录Omicshare课堂www.omicshare.com/class观看学习
    手机端:通过点击基迪奥微信公众号底部菜单栏【视频教程】观看学习


    曼哈顿图R包安装

    #(1)曼哈顿图CMplot包
    ##CMplot是一个方便绘制曼哈顿图的R包,同时可以用于绘制环状曼哈顿图,QQplot,SNP密度图等
    install.packages("CMplot")
    library("CMplot")

    #(2)曼哈顿图qqman包
    # 安装qqman包
    install.packages("qqman")
    library("qqman")

    # (3)自建脚本manhattanplot_function.R依赖的包
    install.packages("gtools")
    install.packages("ggplot2")
    install.packages("scales")

    # (4)基因结构图绘制,Sushi包
    ## try http:// if https:// URLs are not supported
    # 从bioconductor下载Sushi。该包需要依赖很多其他安装包,所以建议在课堂之前提前安装下载;
    source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
    biocLite("Sushi")
    library("Sushi")

    今天的分享就到这里。都说喜欢出门的属狗,喜欢宅家的属猫。宅在家里听网课和到学校上课,你喜欢哪个呢?评论告诉我们吧~



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