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[转录组] 关于转录组实验设计问题

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  • TA的每日心情

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    发表于 2016.9.5 08:52:37 | 显示全部楼层 |阅读模式

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    作为转录组测序方面的一个菜鸟,想请教各位大神一个最近困扰我的问题:本人研究的是小麦的一个自发的黄化突变体,在苗期就显现黄绿色,前人研究表明,此突变体是不完全显性遗传,自交后代有三种类型,即极端黄化,黄绿还有纯绿三种,分离比约为1:2:1.在前人研究的基础上,于今年做了转录组测序,取其构建的近等基因系,于拔节期取极端黄化和纯绿各三个生物学重复,每个重复混样取材,现在测序结果出来了,比较纠结的是:在做验证时就验证拔节期这一个时期还是在不同发育阶段取其根、叶鞘、茎杆、叶和幼穗分别验证呢,因为材料在茎、叶鞘、穗子都表现黄化,请各位能够给予建议
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  • TA的每日心情
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    活跃会员论坛元老


    发表于 2016.9.21 02:24:26 | 显示全部楼层
    既然是验证,不是为了验证而验证。应该是取有生物学意义的基因,在多组织、多时期进行验证。

    可以参考这个帖子:
    用qPCR验证RNA-Seq挑多少个基因合适?
    http://www.omicshare.com/forum/thread-528-1-12.html
    (出处: OmicShare Forum)
    新的一天加油!
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  • TA的每日心情

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     楼主| 发表于 2016.10.8 10:37:43 | 显示全部楼层
    基迪奥-周煌凯 发表于 2016.9.21 02:24
    既然是验证,不是为了验证而验证。应该是取有生物学意义的基因,在多组织、多时期进行验证。

    可以参考这个 ...

    感谢周老师的回复
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