查看: 4293|回复: 7

[软件使用] 有数据想做转录因子预测,求助

[复制链接]

帝王蝶

Rank: 4

主题
4
注册时间
2016.10.11
在线时间
179 小时

发表于 2017.1.5 09:54:51 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,享用更多功能,让你轻松玩转社区。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?立即注册

x
我有一批自己拼接的数据,想做一下转录因子的预测,但不知道有什么好的软件和方法,求大神们告知
回复

使用道具 举报

迅猛龙

Rank: 8Rank: 8

主题
0
注册时间
2016.1.15
在线时间
259 小时

活跃会员


发表于 2017.1.5 11:41:38 | 显示全部楼层
在论坛里以“转录因子预测”为关键词,有很多相关资料
中午好!
回复 支持 反对

使用道具 举报

帝王蝶

Rank: 4

主题
4
注册时间
2016.10.11
在线时间
179 小时

 楼主| 发表于 2017.1.18 09:00:46 | 显示全部楼层
已经解决啦!谢谢大家
回复 支持 反对

使用道具 举报

钵水母

Rank: 3Rank: 3

主题
4
注册时间
2016.4.27
在线时间
28 小时

发表于 2017.11.28 17:14:03 | 显示全部楼层
杨广 发表于 2017.1.18 09:00
已经解决啦!谢谢大家

遇到和您一样的问题,想请教下您是怎么解决的呢
回复 支持 反对

使用道具 举报

帝王蝶

Rank: 4

主题
4
注册时间
2016.10.11
在线时间
179 小时

 楼主| 发表于 2017.12.6 18:45:35 | 显示全部楼层
guaiguai2015 发表于 2017.11.28 17:14
遇到和您一样的问题,想请教下您是怎么解决的呢

和拟南芥的转录因子比对的
plantTFdb
回复 支持 反对

使用道具 举报

钵水母

Rank: 3Rank: 3

主题
4
注册时间
2016.4.27
在线时间
28 小时

发表于 2017.12.8 19:25:25 | 显示全部楼层
杨广 发表于 2017.12.6 18:45
和拟南芥的转录因子比对的
plantTFdb

我看网页版的只能用于不大于100M的蛋白或核酸的比对。我的一个完整的样本测序结果clean data都是7,8G的大小,这个该怎么弄呢?
具体您是怎么解决的呢?
回复 支持 反对

使用道具 举报

帝王蝶

Rank: 4

主题
4
注册时间
2016.10.11
在线时间
179 小时

 楼主| 发表于 2017.12.15 08:29:10 | 显示全部楼层
guaiguai2015 发表于 2017.12.8 19:25
我看网页版的只能用于不大于100M的蛋白或核酸的比对。我的一个完整的样本测序结果clean data都是7,8G的 ...

我先把差异基因提取出来,没有大于100M,所以用网页版做的
回复 支持 反对

使用道具 举报

钵水母

Rank: 3Rank: 3

主题
4
注册时间
2016.4.27
在线时间
28 小时

发表于 2017.12.18 10:01:50 | 显示全部楼层
杨广 发表于 2017.12.15 08:29
我先把差异基因提取出来,没有大于100M,所以用网页版做的

好的,谢谢你
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

快速回复 返回顶部 返回列表