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[转录组] 转录因子靶基因互作关系的建立

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  • TA的每日心情

    2017.10.9 16:48
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    发表于 2017.10.5 08:32:33 | 显示全部楼层 |阅读模式

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    大家好,想请教大家的是,本人做了转录组测序,现挑选了一些转录因子,在差异基因中已预测了靶基因,那怎么知道这些转录因子和靶基因的互做关系呢?是促进还是抑制?
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  • TA的每日心情

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    发表于 2017.10.5 15:16:33 | 显示全部楼层
    请教,靶基因你怎么预测的
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  • TA的每日心情

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    发表于 2017.10.6 22:44:50 | 显示全部楼层
    怒火凤凰 发表于 2017.10.5 15:16
    请教,靶基因你怎么预测的

    同问啊
    新的一天加油!
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  • TA的每日心情

    2017.10.9 16:48
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     楼主| 发表于 2017.10.9 09:58:53 | 显示全部楼层
    具体是这样的:删选出来的转录因子,在plantTFDB数据库里找的对应物种的转录因子,根据关注的差异基因启动子区域是否有转录因子的结合位点预测它们的靶基因,我的理解是这样的,不知道对不对
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    发表于 2017.11.1 10:15:45 | 显示全部楼层
    那您是怎么找到差异基因的启动子区域呢?
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  • TA的每日心情

    2018.3.1 17:54
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    [LV.3]偶尔看看II

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    发表于 2017.11.2 09:04:29 | 显示全部楼层
    要看促进还是抑制只能实验验证了,不能老是靠生信
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