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如何绘制漂亮的“花瓣”韦恩图?

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  • TA的每日心情

    2019.9.23 10:01
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    发表于 2018.11.21 09:22:31 | 显示全部楼层 |阅读模式
    之前在《韦恩图的绘制与个性化调整》一文中介绍过常规韦恩图的画法,在拿到各个集合数据后,如果想画更具个性化的3个“花瓣”韦恩图(如下图),其实你也可以用PPT,Illustrator等手工绘制。


    (Nature genetics,2016)
    如果想画一些文章中形似“向日葵”、“百日草”之类的韦恩图其实你还可以用OmicShare tools。之前我一直以为OmicShare的韦恩图工具最多只支持5列数据的绘制,其实它还有隐藏的彩蛋:当你的数据超过5列之后,OmicShare默认绘制漂亮的“花瓣”韦恩图! 下面就一起看下如何绘制“花瓣”韦恩图吧~ 数据准备 为了便于理解和展示,这里用到的数据非常简单:7列数据(可视作7个样本的数据)有3个gene ID完全一样,另外3个 gene ID完全不同,也就是说每个样本都有3个特有的基因,如下图。



    然后,将表格中的数据另存为制表符分隔的txt文件。
    韦恩图绘制 登陆OmicShare后,通过 我的软件/基础绘图 单击韦恩图工具,如下图,便可进入数据选择提交页面。



    点击 选择文件 按钮,选择刚才保存的制表符分隔的txt文件,然后点蓝色的提交按钮即可完成绘制。



    在我的任务页面点刷新任务状态按钮之后,点结果预览按钮 可查看绘制的结果。



    在结果预览窗口,你可以更改字体的大小和每片花瓣的颜色,点击花瓣上的数字可查看对应的gene ID,你可以对感兴趣的gene ID的集合以表格的形式下载下来,方便做进一步的研究。当然你也可以点查看结果按钮,把整体结果下载下来。



    最后,下载svg格式的矢量图。
    个性化调整
    感觉“7色花”的花瓣数量还是有点少,我们再增加5列数据,用同样的方法完成绘制。之后用Adobe Illustrator(Ai)可单独调整“花心”和“花瓣”的大小和颜色。



    如果不想逐个调整花瓣的颜色,也可以选中花瓣后点击重新着色图稿按钮,如下图虚线框所示,进行整体的配色调整。




    你可以在颜色组的下拉列表中选择围绕主色调(下图为红色)的配色方案,实现丰富的色彩搭配效果。




    最终的效果如下:





    参考文献Cheng,Feng, etal. Subgenome parallel selection is associated with morphotype diversificationandconvergent crop domestication in Brassica rapa and Brassica oleracea.Nature genetics 48.10 (2016): 1218.

    本文作者:基迪奥莫北

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    发表于 2018.11.22 09:14:18 | 显示全部楼层
    挺好看的
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    发表于 2018.11.23 13:14:45 | 显示全部楼层
    好看的
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  • TA的每日心情

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    发表于 2018.12.8 10:16:51 | 显示全部楼层
    谢谢,学习学习
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  • TA的每日心情
    忙~
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    发表于 2018.12.8 21:23:52 | 显示全部楼层
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    发表于 2018.12.20 15:03:13 | 显示全部楼层
    恩,应该能用到
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  • TA的每日心情
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    发表于 2018.12.20 19:27:39 | 显示全部楼层
    嗯 好看
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  • TA的每日心情
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    发表于 2019.1.27 22:42:03 | 显示全部楼层
    怎么韦恩图软件说明是超过五维画不出图形呀?
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  • TA的每日心情

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     楼主| 发表于 2019.1.28 09:19:26 | 显示全部楼层
    张高兴儿 发表于 2019.1.27 22:42
    怎么韦恩图软件说明是超过五维画不出图形呀?

    超过五组就变成这种韦恩图了。
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  • TA的每日心情
    吃饭
    4 天前
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    发表于 2019.1.28 12:14:16 | 显示全部楼层
    优秀!
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  • TA的每日心情
    yes!
    2019.3.6 19:04
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    发表于 2019.3.6 16:55:26 | 显示全部楼层
    韦恩图可以画出14维的吗?
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  • TA的每日心情
    yes!
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    发表于 2019.3.12 17:54:18 | 显示全部楼层
    很好看的维恩图
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  • TA的每日心情
    好棒
    2019.7.25 15:09
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