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简并引物设计的问题,求答案。

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钵水母

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发表于 2019.3.7 15:34:04 | 显示全部楼层 |阅读模式

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找到了7个保守区块,用primer5设计简并引物,修改软件里面关于引物位置、长度、产物长度等信息后,显示没有可用的引物。求解,是我做的方法不对吗?如果方法正确,还有没有什么别的办法
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发表于 2019.3.7 16:03:57 | 显示全部楼层
没想到现在还有人要设计简并引物,几年前我们设计的时候,直接取保守区域,做一个SeqLOGO或者WebLOGO,然后手动输入就可以了。没有那么多复杂的东西
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帝王蝶

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发表于 2019.3.7 16:43:01 | 显示全部楼层
不要用primer 直接在保守区,眼睛看着选择
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帝王蝶

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发表于 2019.3.7 18:27:49 | 显示全部楼层
里面是不是有一些参数没有设置,比如退火温度这些?或者试一试oligo?
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发表于 2019.3.7 19:33:08 | 显示全部楼层
没想到现在还有人要设计简并引物,几年前我们设计的时候,直接取保守区域,做一个SeqLOGO或者WebLOGO,然后手动输入就可以了。没有那么多复杂的东西
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发表于 2019.3.13 18:51:55 | 显示全部楼层
注意引物的特异性以及GC含量,最后三个碱基不要是连续的G或者C就行。
New beginning~
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钵水母

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发表于 2019.9.17 14:34:07 | 显示全部楼层
我也在设计简并引物,你现在设计有进展了吗,可以交流下!
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