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[转录组] 哥本哈根大学DynaMo研究中心揭示MYB-bHLH互作特异性结合的基序

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    发表于 2019.8.13 14:42:56 | 显示全部楼层 |阅读模式

    转录因子(TF)参与多细胞生物中从生长发育到应激反应等所有生理过程的调节。在高等植物中,MYB和螺旋-环-螺旋(bHLH)TFs是两个最丰富的TF家族,每个家族在拟南芥中含有超过一百个成员。MYB和bHLH TFs之间的相互作用是普遍存在的,已有大量研究表明,MYB-bHLH复合物通过组合效应产生相应的表型变化,不同的MYB-bHLH结合位点必须能够实现高度特异性的相互作用,但在大多数情况下,这一特性我们尚不清楚。
    2019年8月10日,Nucleic Acids Research在线发表了丹麦哥本哈根大学植物与环境科学系DynaMo研究中心Meike Burow团队题为“Specificity of MYB interactions relies on motifs in ordered and disordered contexts”的研究论文,该研究确定了负责介导subgroup 12中的MYB TFs与MYC3和MYC4之间相互作用的基序。



    在MYB-bHLH相互作用特异性方面,特别值得关注的一个MYB亚组是subgroup 12,其与bHLH配偶体MYC3和MYC4互作的生物学功能已经阐明,即调节硫代葡萄糖苷的生物合成,从而影响对食草动物的适应性。同时,在bHLH方面,结合位点的研究已经基本明晰,包括JAZ相互作用结构域、MYC3的晶体结构单独解析等。然而,在MYB方面,没有关于结合位点的报道,并且来自subgroup 12的MYB TFs不包含RB基序,因此,这些MYB蛋白质如何与其bHLH配偶体相互作用尚不可知。在这项研究中,作者发现subgroup 12中的MYB TFs与MYC3和MYC4之间的相互作用不是通过R3,甚至是DBD介导的,而是通过位于非MYB区域中心的一个保守基序;该基序显示出短线性基序(SLiM)的特征,因此进化上不太可能与RB基序相关。该基序与subgroup 12的定义基序[L/F] LN [K/R] VA一致。因此,我们能够将MYC-相互作用基序的核心残基MIM定位到三个关键位置。


    图1 MYB-bHLH相互作用的特异性依赖于背景依赖性的基序。本研究提供了在植物MYB TFs的DBD之外发生的调节活性的实例,也突出强调了确定蛋白质家族中某些亚组特异性基序的分子功能的重要性。


    原文链接:https://academic.oup.com/nar/adv ... /nar/gkz691/5545731

    本文转载自微信公众号:植物生物技术Pbj


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