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[视频教程] 如何分析一个基因家族相关的上调下调基因呢

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  • TA的每日心情

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    发表于 2019.10.15 15:39:16 | 显示全部楼层 |阅读模式

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    生信小白请教诸位大神,
    1.如果已知一个基因家族所有基因的相关上调和下调基因,如何能作整个基因组的GO分析和KEGG分析的图?
    2.如果不能,该如何使用在线分析网站分析这个基因家族相关的上调下调基因呢?cbioportal 中的co-expression已经没了。再绘制GO分析和KEGG分析的图?
    3.文章中放整个家族基因组的GO分析和KEGG分析的图好?还是单个基因分别的GO分析和KEGG分析的图好?


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    发表于 2019.10.16 14:45:39 | 显示全部楼层
    我认为你的问题就有很多问题,让人不知道如何回答。可能你对GO、kegg分析理解有误区。比如第三个问题,单个基因怎么做GO分析?
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  • TA的每日心情

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     楼主| 发表于 2019.10.16 21:47:09 | 显示全部楼层
    基迪奥-周煌凯 发表于 2019.10.16 14:45
    我认为你的问题就有很多问题,让人不知道如何回答。可能你对GO、kegg分析理解有误区。比如第三个问题,单个 ...

    谢谢老师的回复。
    单个基因应该不能作功能富集,应该必须寻找这个基因共表达的一些基因才能行。
    比如知道RUN1和它的共表达基因就能作GO和KEGG的分析。
    如果我想做整个RUN家族的GO分析和KEGG分析应该寻找整个家族的相关共表达基因是吗?
    那如何挖掘一个基因家族比如RUN家族共表达的基因呢?能用在线数据库完成这一操作吗?
    谢谢老师
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    发表于 2019.10.17 21:17:00 | 显示全部楼层
    天天开心1 发表于 2019.10.16 21:47
    谢谢老师的回复。
    单个基因应该不能作功能富集,应该必须寻找这个基因共表达的一些基因才能行。
    比如知道 ...

    我觉得你的问题最好的方式是,直接搜索 论坛其他帖子
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  • TA的每日心情
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    发表于 2019.10.29 08:29:53 | 显示全部楼层
    我也想知道。
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