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利用统计检验寻找富集GO功能,并通过图表交互形式对结果进行动态分析。

42

利用统计检验寻找富集KO功能,并通过图表交互形式对结果进行动态分析。

12

可个性化筛选数据,并获得物种分类和OTU水平的样本距离,以PCoA和热图直观展示。

11

将两个表格合并成一个表格

177

将多个表格合并成一个表格

117

将表格中的行与列互换

88

筛选关注的表格信息

167

设置碱基或氨基酸数量,描述信息保留与否、是否转为小写、获取反向互补序列

39

统计所有序列的长度

53

筛选特定长度的范围的序列

46

截取序列的指定区段,分为单区段序列截取和多区段序列截取两种模式

53

实现DNA与RNA互相转换

40

把CDS fasta序列转换成蛋白序列

51

原始序列和目标序列来进行Blast序列比对,并输出比对结果

84

多序列比对工具

63

将SVG格式转换成其它常用格式

65

解读SAN flag

25

把fastq文件转换为fasta文件

32

将表格数据绘制成一个散点图

90

将表格数据绘制成一个折线图

79

将表格数据绘制成一个柱状图

91

将表格数据绘制成一个频率直方图

66

将表格数据绘制成一个面积图

43

将表格数据绘制成一个盒形图

152

将表格数据绘制成一个气泡图

121

将表格数据绘制成一个热图

714

用来显示数据元素重叠区域

447

在清楚看到层级关系的情况下,动态展示各部分所占比例

44

将表格数据绘制成一个可包含辅助线和相关系数的散点图

104

将表格数据绘制成包含趋势线的散点图

77

将表格数据绘制成一个3D散点图

71

将表格数据绘制成一个饼图

90

将表格数据绘制成一个小提琴图

29

利用N个表格数据绘制分组小提琴图

12

根据不同的类或簇之间的相似性与差异性,进行分类

189

可以找到具有相同表达模式的基因

275

一款图形化显示有向网络并进行分析和编辑的软件

117

用两组样品间的差异基因绘制火山图

279

用两组样品间的差异基因绘制MA图

83

用edgeR计算两组样本之间差异表达的基因

259

一款图形化显示权重网络并进行分析和编辑的软件

108

组内相关性分析及热图展示

26

组间相关性分析及热图展示

26

转录组与蛋白组关联分析

18

应用超几何检验,找出与整个基因组背景相比,在差异表达基因中显著性富集的Pathway

534

应用超几何检验,找出与整个基因组背景相比,在差异表达基因中显著富集的GO条目

534

KEGG富集分析结果的可视化

296

根据基因的COG/KOG ID或COG/KOG code绘制柱状统计图

109

绘制一组或多组数据的GO二级分类注释柱状图

135

将物种分组和丰度信息以circos图展示

25

将多个变量通过线性变换,筛选出数个比较重要的变量。

295

将多个变量通过线性变换,筛选出数个比较重要的变量,用3D形式展示出来

126

利用(O)PLS-DA分析,计算两个分组的差异物质(如代谢物)

130

线性模型将样本距离进行降维展示

86

非线性模型将样本距离进行降维展示

62

计算并展示环境因子、微生物群落和样本关系

21

ROC曲线用来评价一个二值分类器(如生物标记物)的优劣

30

进行两组样本的差异分析,使用R语言进行t检验

25

进行两组样本的差异分析,使用R语言进行t检验

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